比目鱼眼睛位置都是在同一侧吗？

不是

比目鱼并非生来眼睛都长在同侧。刚刚孵出时，身体对称，两只眼睛也是分别长在身体两侧的。出生后不久，颅骨开始不对称发育，它们也变得越来越不对称，其中一只眼睛不断地向着另一侧移动，最终出现了“比目"的效果。